A coleção de Etnografia é composta por objetos e testemunhos ligados à presença missionária da Ordem Hospitaleira nas ex‑colónias de Moçambique e Angola, no Brasil e, atualmente, em Timor‑Leste. Muitos dos objetos aqui reunidos foram oferecidos pelas próprias comunidades, reconhecendo a importância da ação hospitaleira e a relação de confiança construída ao longo dos anos.
Este conjunto permite alargar o olhar sobre a missão da Ordem Hospitaleira, revelando a sua dimensão histórica, social e multicultural, mostrando como a missão de Hospitalidade se expressou também no encontro entre diferentes culturas, tradições e modos de vida distintos.